Pierwotnie, gra miała się różnić w kilku aspektach względem ostatecznej wersji. Jednym z charakterystycznych elementów jest początek gry. Snake nie skacze z Mostu Waszyngtona na linie, zamiast niej ma mały spadochron na plecach. W tej wersji to spadochron posiada zminiaturyzowane urządzenie stealth. Skrzydła są automatycznie otwierane za pomocą automatycznego urządzenia otwierającego (AOD), deszcz który spada na spadochron zarysowuje jego niewidzialny kształt na niebie.
Dalej widzimy jak członek załogi włącza autopilota Tankowca, po tym jak statek przepływa pod wspomnianym mostem. Następnie ów członek ziewa i wygląda przez okno. Wycieraczki usuwają wilgoć z szyb, od lewej strony zaczynają materializować się światła Manhattanu. Członek załogi, zaabsorbowany widokiem, jednak nie zauważa Snake'a.
Kolejne wersja wydarzeń wygląda podobnie: uderzenie przy lądowaniu, psuje urządzenie stealth co sprawia że Snake jest zmuszony do jego dezaktywacji przez co staje sie widoczny jak na dłoni. Solid odcina spadochron i przyczepia skrzydła do liny na plecach, której drugi koniec był przywiązany do barierki na moście na górze, która wraz z ruchem Tankowca napina się. Po pełnym napięciu liny, Snake puszcza swój sprzęt który wraca na most.
I wszystko wraca do normy, choć dowiadujemy się jeszcze że nasz bohater miał mieć na sobie strój z Shadow Moses, który był w kilku miejscach naprawiany. W kwestii sprzętu, Snake miał mieć na wyposażeniu Berettę.