Scenariusz MPO

Na początku gry Campbell ma złamaną nogę, dlatego też prowadzi on ciężarówkę, a Snake rusza na misję. Może dlatego Campbell ma laskę w trailerze z MGS4.

Cunnigham przesłuchuje Snake’a w sprawie dziedzictwa. Oddział FOX sądzi, że Snake wie gdzie znajduje się druga połowa dziedzictwa. Natomiast nasz bohater uważał iż CIA posiada całość. Cunnigham w to nie wierzy, ale Snake mówi całą prawdę.

Cunnigham pyta co się naprawdę stało w czasie operacji Snake Eater. Big Boss przypomina sobie Shagohoda, Ele i The Boss. Cunnigham odchodzi nie uzyskując odpowiedzi.

Ursula, posiadająca spore zdolności psychokinetyczne członkini FOX, jest prawdziwą zabójczynią, a jej mniej uzdolniona siostra, pracownik medyczny oddziału FOX, każe Snake’owi zabić swoją bliźniaczkę natychmiast gdy się z nią spotka. Elisa opiekuje się Nullem, który jest ostatnim eksperymentalnym żołnierzem projektu Perfect Soldier. Null w tym wypadku ma oznaczać – nienazwany podmiot, gdyż w czasie testów nie miał ani numeru, ani pseudonimu.

Elisa obawia się, że jej siostra straciła już wszystkie ludzkie uczucia. W młodości obie znajdowały się po wschodniej stronie muru berlińskiego. Gene zabrał je ze sobą.

Sowieci zrezygnowali z tajnej bazy w Ameryce Południowej, zostawiając w niej swoich żołnierzy mówiąc, że to była ich własna rebelia i oni za to nie odpowiadają.

Gene przemawia do żołnierzy, którzy budowali coś naprawdę ogromnego, a jego głos ma na nich jakichś wpływ…Mówił o tym, że chce stworzyć naród, w którym żołnierze nie są narzędziami rządu. Dokładnie to samo co w późniejszym okresie chciał zrobić Big Boss w Outer Heaven. Pod koniec przemowy, żołnierze salutują Gene’owi dziękując mu za to iż mają jakiś cel w życiu.

Snake walczył z Nullem, po walce przypomina sobie dziecko z Mozambiku. Cunnigham uderza Snake’a i ponownie zaprowadza do celi.

Snake dochodzi do przystaniu, gdzie wg. Elisy miał coś znaleźć. Słyszy głosy. Python, dawny przyjaciel z pola walki i sowiecki dowódca, który zwariował gdy ZSRR zostawiło bazę. Python szukał Snake’a. Dowódca zależy do niego strzelać, jednakże Python wychodzi z tego bez szwanku, łapie Rosjanina i wrzuca go do celi.

Snake podchodzi do celi i dowiaduje się jakim typem człowieka jest Gene’a, oraz jak przejął bazę w 4 tygodnie, po czym go uwalnia.

W czasie przechadzki po statku znajduje wielkie pudło oznakowane US i dochodzi do wniosku, że znajduje się tam wielki czołg, zdecydowanie poruszający się po ziemi.

Chwilę potem ktoś do niego dzwoni. Mężczyzna przedstawia się ‘Prividyenie’, lub po prostu ‘Ghost’. Nie widać jego twarzy, mówi, że oddział FOX ukradł najnowszą broń. Odwołuje się do Shagohoda Sokolova i Metal Geara Granina, opisując jak rząd amerykański zdobył plany broni. Nowa broń o której mówi Ghost może strzelać do wielu celów na raz i jest chodzącym, cztero nożnym czołgiem – Metal Gearem. Snake pyta Ghosta czy jest Graninem, otrzymuje odpowiedź, że nie bo Granin umarł.

Python prawie umarł 10 lat temu w Wietnamie Dziesieć lat temu, The Boss zostawiła Snake’a, a Python był jednym z nielicznych ludzi, na których mógł wtedy liczyć. CIA trzymała go przy życiu dzięki strojowi z ciekłym azotem, tylko by mógł pokonać Snake’a. To on jest ‘Anti-Snake’.

CIA bała się Big Bossa, ponieważ to on pokonał The Boss i odziedziczył jej tytuł. Potrzebowali ludzi, którzy mogliby go pokonać, gdyby zdradził

Gene rozmawia ze Snake’iem. Tłumaczy mu, że to wszystko jest ustawione przez CIA. ‘Kradzież’ Metal Geara, przez FOX to plan CIA. Chcieli dać ZSRR nowego Metal Geara, udając, że FOX przechodzi na ich stronę. Miało to przedłużyć Zimną Wojnę, utrzymać równowagę.

Gene mówi także iż jest bratem Snake’a. Projekt Successor (następca), Snake przejął tytuł The Boss i został Big Bossem, a Gene przejął jej ‘głos’. Projekt ten miał na celu stworzenie idealnego dowódcy. Gene walczy jak The Boss, a refleks ma lepszy niż Null. Oczywiście za tym projektem stoi CIA.

Gene rozmawia z Ocelotem. Przekazuje mu wszystkie informację, oraz mówi, że CIA musi być teraz zdezorientowane.

Null ucieka ze swojej skrzyni, zabija kilku żołnierzy i domaga się dokończenia misji, chce zabić Snake’a.

Gene rani Nulla i mówi mu, że odpuści wykonanie zadania. Null słabnie i zostaje zabrany przez żołnierzy.

Elisa idzie do celi, w której jest Big Boss. Przytula go i poprzez telekinezę, mówi mu co zamierza Gene i że miała wizję jak Snake niszczy Metal Geara.

Snake zostaje uratowany przez swój oddział, ale pojawia się Cunnigham na latającej platformie i domaga się by ten powiedział mu, gdzie jest druga połowa dziedzictwa, albo powybija cały jego zespół. Snake przysięga, że nic nie wie, ale Cunnigham rani dwóch żołnierzy. Wielki murzyn mówi: ‘Pentagon powiedział, że masz drugą połowę dziedzictwa’. Snake nie wie co się dzieje.

Elisa przybywa razem z ciężarówką i wyciąga Snake’a i jego ludzi. Spotykają się z Campbellem, który mówi, żeby ten dał spokój tej dziewczynie i poczekał 5 lat, aż stanie się prawdziwą kobietą.

Snake rozmawia z Elisą, chce się dowiedzieć dlaczego ona mu pomaga. Ta mówi, że zostawiła Gene’a z powodu bomb atomowych. Mimo zdrady, jest wdzięczna za to co dla niej zrobił.

Rodzica Elisy i Ursuli zgineli w przypadkowym wybuchu nuklearnym w ZSRR. One same zostały napromieniowane i dlatego mają moc psychokinezy. Snake mówi, że on także został napromieniowany na Atolu Bikini. Elisa mówi, że nigdy nie będzie miała dzieci, a Snake’owi życzy by był świetnym ojcem, ale on odpowiada ‘Przykro mi, ale nigdy nie będę ojcem…’

Snake, wraz z zespołem i Elisą atakują Metal Geara, ale Gene i jego ludzie zastawili na nich zasadzkę. Metal Gear został aktywowany, ale przez kogo? Rosyjski dowódca zwariował, strzela z karabinów prosto w Gene’a, ale pudłuje. Gene po raz kolejny powtarza ‘Los nie pozwoli by coś mi się stało’. Snake zakrada się za Gene’a i mówi, że to koniec. Ten jednak używa swojego asa z rękawa, którym o dziwo nie jest Metal Gear i używając swojego głosu przywołuje Ursulę…Elisa mówi, żeby Snake ją zabił, albo ona zabije jego i jego przeklęte dzieci. Elisa i Ursula to ta sama osoba. Ursula przejmuje kontrolę nad Metal Gearem.

Elisa genie w wybuchu Metal Geara.

Ludzie Gene’a zaczynają mówią do siebie: ‘To jest Big Boss’, ‘Człowiek zniszczył Metal Geara…’, ‘Nasz naród nigdy nie powstanie’

Gene mówi Snake’owi ‘Nic dziwnego, że Ocelot cię podziwia’. Snake odpowiada: ‘Ocelot? Ocelot z GRU? Co on ma z tym wspólnego?’

Sokolov żyje, to on jest Ghost. Stąd wiedział o broni Granina. Gene pomógł mu wydostać się z ZSRR. W końcu dostał się do USA, gdzie pomógł CIA zbudować Metal Geara. Sokolov pomaga Snake’owi. Gene powiedział, że naukowiec był głupcem, gdyż nie wiedział, że CIA pewnego dnia skieruje Metal Geara w stronę ZSRR.

Metal Gear RAXA, który Snake zniszczył był tylko prototypem, który miał dać Gene’owi więcej czasu na przestawienie prawdziwego Metal Geara w inne miejsce i przygotowanie nuklearnego ataku.

Gene używając swojego głosu, sprawił że jego ludzie zaczęli się bać samych siebie i śmieje się, gdy zaczęli do siebie strzelać. Następnie mówi o tym jak dzisiejsi przyjaciele mogą jutro stać się wrogami i jak ludzie z tego samego kraju w pewnym momencie zabiją własnego brata w czasie wojny. Sokolov wariuje, a Snake stoi nie wzruszony. Jeden z jego ludzi ginie chroniąc swojego przywódcę.

Snake mówi do Nulla: ‘Znam cię…masz imię, Frank Jaeger’. Null powoli wariuje.

Pojawia się Cunnigham, mówi Big Bossowi, że sprawił się świetnie i może już wracać do domu. Snake ponownie nie wie co ma zrobić.

Cunnigham mówi, że tak naprawdę nie robi wszystkiego co każe Gene. Pracuje dla Pentagonu i chce zmusić Gene’a do odpalenia bomby atomowej w kierunku ZSRR. Mówi iż CIA i Pentagon nigdy się nie dogadywały. Nienawidzi CIA za to co mu zrobili. Gdy stracił nogę, został odsunięty przez CIA, chcąc zemsty przyłączył się do Pentagonu.

A gdy Gene wykończył zadanie, Cunnigham chce wysadzić bazę przy pomocy Davy Crocketta. Następnie nakazuje Snake’owi uciec w helikopterze, dzięki czemu po powrocie do USA zostałby bohaterem. Snake przypomina sobie tych, którzy już zginęli: Elisę, Johnathana (żołnierza który go ochronił).

Snake wyciąga pistolet i mówi: ‘Jestem wierny sobie. Nie będę żył tak jak The Boss’. Na co Cunnigham odpowiada, że teraz stał się prawdziwym zdrajcą.

Po walce Cunnigham grozi, że odpali rakietę i zabije wszystkich. Pyta dlaczego Snake zrezygnował z możliwości zostania bohaterem. Tuż przed odpaleniem rakiety, jego platforma wybucha, a on umiera.

Snake dostaje się do laboratorium w którym Gene ma aktywować Metal Geara. Widzi tam Gene’a i dwóch inżynierów, martwy na ziemi. Wywiązuje się dialog:
’Zabiłeś ich!’ – mówi Snake
’Nie, oni sami się zabili wiedząc, że są laleczkami Pentagonu’ – odpowiada Gene
’A ty? Też jesteś laleczką’
’Nie, wiem czego chcieli Cunnigham, CIA i Pentagon’
Gene miał własne plany co do tej bazy.

Nie chciał uderzyć w ZSRR, chciał zaatakować stan Wirginia. Chciał zniszczyć CIA i Pentagon (dwie siedziby Filozofów), przez co zlikwidowałby Filozofów.

Snake jest w szoku.

Gene wyjaśnia jak wszystko zostało ustawione w czasie operacji Snake Eater (Snake nic o tym nie widział). Gene mówi, że to ‘on’ zaplanował zabicie The Boss. Snake żąda informacji o tym kim jest ‘on’. Gene oczywiście nie mówi.

Mówi natomiast o tym, że ta baza wcale nie miała być narodem dla żołnierzy, ale chciał stworzyć taką fortecę i nazwać ją Army Heaven. Kryłaby się w cieniu na całym świecie. Snake rzecze: ‘To czego żołnierze naprawdę pragnę jest poza twoim Niebem’.

Gdy Gene zamierza wystrzelić Metal Geara w stronę Wirginii, konsola wybucha. Gene krzyczy ‘Ursula!’. Ta mówi, że broń atomowa jest zła, zabija wszystko i opowiada o całym żalu jaki widziała.

Gene próbuje zabić ją nożem, ale ona go blokuje. ‘Czytasz w moim umyśle. Chyba przestałem się pilnować, gdy sądziłęm, że umarłaś’. Nagle pojawia się tuż przed nią i dźga ją w brzuch.

Gene podchodzi do kolejnej konsoli, a Snake trzyma Urszulę (a raczej Elise), która mówi ‘To co widziała, stanie się naprawdę. Zniszczysz Metal Geara i to miejsce, a potem stworzysz własnego Metal Geara’

’Twoje dzieci…Les Infant Terribles…Twoi synowie doprowadzą świat na skraj upadku…twój syn uratuje…’

Snake pyta o co tak naprawdę chodzi, ale jest za późno. Elisa już nie żyje.

Po walce z Genem.

Gene mówi, że geny żołnierskie się nie mylą. Mówi, że to Snake jest prawdziwym następcą. A ten pyta o co mu chodzi.

Gene rzuca coś Snake’owi i mówi:
’To film, zabrałem dużo pieniędzy na rzecz Army Heaven i oddaję je tobie Snake. Odziedziczyłeś moje geny, jesteś prawdziwym następcą, bądź wierny sobie i znajdź własne powołanie.’ Gene mówi Snake’owi to co Snake powtarza Solidowi w MG2. ‘Ktokolwiek wygra, walka się nie skończy. Wygrany zostanie uwolniony z pola walki, ale zwycięzca na nim pozostanie. Będzie żołnierzem aż do swojej śmierci.’

Następnie każe Snake’owi szybko uciekać.

Oczywiście przed ucieczką jest jeszcze coś do zrobienia. Trzeba powstrzymać Metal Geara. Odliczanie już się rozpoczęło, zostały jeszcze dwie minuty. Snake dzwoni do Sokolova, który mówi, że już jest za późno, a pancerza nie da się przebić. Snake próbuje z RPG, ale to nic nie robi. Nagle widzi jak w stronę Metal Geara lecą kule. To radzieccy żołnierze. Snake krzyczy do nich: ‘Co wy tu do diabła robici!? Uciekajcie stąd, póki macie czas!’

Żołnierze odpowiadają: ‘Ocaliłeś naszą ojczyczę, teraz nasza pora ocalić twoją. Dałeś nam prawdziwy powód do walki Big Bossie’.

Snake strzela z RPG w Metal Geara, trafia, ale ten już wylatuje w kosmos. Następnie widać, że Metal Gear jest uszkodzony i zbacza z kursu. Sokolo mówi, że się udało i zatrzymał czołg.

Przejście do innego miejsca.

’Nazywam się Adam i miło mi w końcu pana poznać, panie dyrektorze’
’To ty jesteś tym potrójnym szpiegiem Filozofów. Nie mam teraz czasu’
Szef i jego ludzie biegli do schronu, Ocelot pyta co ma przy sobie. Dyrektor odpowiada, że jest to lista wszystkich Filozofów, miejsca gdzie jest trzymana reszta
dziedzictwa i że nawet jeżeli USA zostanie zniszczone Filozofowie powstaną ponownie, a to trzeba zachować.
’To chciałem usłyszeć’, Ocelot zabija agentów
’Co ty robisz!? Zdradzasz Filozofów?!’ – pyta dyrektor
’Nie, wykańczam ich. Przyszedłem zabrać wam to, co zabraliście nam. Podtrzymuję ducha prawdziwego patriotyzmu. Naszym planem jest uczynić świat, który ona widziała rzeczywistością. Przybyłem bo drugą połowę dziedzictwa.’, po czym zabija dyrektora.

Snake wraca do stanów, gdzie witają go różni ludzie, w tym Sigint. Słychać jak Snake rozmawia z Campbellem. Mówi mu, że CIA wszystko zatuszuje, mówiąc, że udał się do Ameryki Południowej by powstrzymać FOX. Snake pyta jak radzi sobie Frank. Campbell odpowiada, że jest w fatalnym stanie i dużo czasu zajmie powrót do zdrowia. Kilku rannych żołnierzy salutuje Snake’owi. Snake mówi Campbellowi, by przekazał dalej to co zostało mu przekazane.

Snake siedzi na łóżku, obok na stole jest dokument, a na nim logo. Nie widać go dokładnie, ale to logo Fox Houndu.

Przewijają się napisy, w tle leci utwór ‘Calling to the Night’

Obowiązkowa rozmowa telefoniczna.

Ocelot:
’Czyli to ty dostarczałeś mi informacji. Tak, oficjalna wersja będzie o samobójstwie dyrektora. Będzie dokładnie tak jak chciałeś. Już więcej nie będę ci potrzebny…Dane z pola walki projektu Perfect Soldier? Geny? Genotypy? Rozumiem…Ciekawe…Pomogę ci w tym projekcie, ale chcę by on się do nas przyłączył. Tak, Big Boss. Byśmy stali się Patriotami’

Koniec gry